وبهذا تكون الجامعة رائدة في مجال الدراسات العليا في مملكتنا الحبيبة ، وقد نوقشت في الجامعة أول رسالة ماجستير على مستوى المملكة العربية السعودية في 3 / 2 / 1392 هـ ثم تتابع افتتاح أقسام الدراسات العليا حتى زادت على خمسين برنامجاً لدرجات : الدبلوم والماجستير والدكتوراه في مختلف الكليات والأقسام ، وفي عام 1413 هـ أنشئت عمادة الدراسات العليا بموجب القرار رقم 9 للمجلس الأعلى لجامعة أم القرى في جلسته (25) بتاريخ 17 / 2 / 1413 هـ لتتولى الإشراف على أقسام الدراسات العليا بالجامعة ومتابعة شئونها وأصبحت بحمد الله تؤدي دوراً بارزاً وملموساً تجاه طلاب وطالبات الدراسات العليا بدءاً باستقبالهم للالتحاق بالبرنامج وانتهاء بمنحهم الدرجات العلمية .