تتضمن هذه القوائم معلومات عن الكتب والبحوث التي تمت طباعتها بمعهد البحوث العلمية طبقا لكل مركز بحثي :

1-  مركز بحوث إحياء التراث الإسلامي

2-  مركز بحوث الدراسات إسلامية

3-  مركز بحوث التعليم الإسلامي

4-  مركز بحوث التربوية والنفسية

5-  مركز بحوث العلوم التطبيقية

6-  مركز بحوث العلوم الاجتماعية

7-  مركز بحوث اللغة العربية

8-  مركز بحوث العلوم الهندسية والمعمارية

9-  مركز بحوث الطب والعلوم الطبية

10- سلسلة الرسائل العلمية الموصى بطبعها

11- فهارس المخطوطات والأدلة

12- كتب وأبحاث تحت الطبع